Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms