Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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