Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD1Q13393 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms