Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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