Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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