Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms