Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMSAP2Q08AD1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMSAP2Q08AD1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms