Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms