Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms