Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms