Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms