Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms