Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms