Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms