Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms