Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF3P78545 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF3P78545 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF3P78545 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms