Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms