Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms