Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CABP4P57796 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms