Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIRAP54198 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIRAP54198 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIRAP54198 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms