Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GBX2P52951 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GBX2P52951 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBX2P52951 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms