Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms