Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM1P49642 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms