Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms