Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTHFRP42898 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTHFRP42898 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms