Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3CBP42338 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms