Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPS1P31327 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPS1P31327 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPS1P31327 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPS1P31327 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPS1P31327 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPS1P31327 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms