Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms