Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms