Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms