Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms