Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms