Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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