Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME1P15531 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME1P15531 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME1P15531 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME1P15531 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME1P15531 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME1P15531 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME1P15531 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME1P15531 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME1P15531 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms