Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRF1P14222 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRF1P14222 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRF1P14222 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRF1P14222 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms