Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEFHP12036 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEFHP12036 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEFHP12036 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms