Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms