Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms