Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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