Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC1P02654 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms