Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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