Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms