Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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