Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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