Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA2O00451 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA2O00451 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA2O00451 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms