Protein–RNA interactions for Protein: C9JLR9

C11orf95, Uncharacterized protein C11orf95, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf95C9JLR9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf95C9JLR9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf95C9JLR9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms