Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NL46 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
A6NL46 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A6NL46 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A6NL46 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A6NL46 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A6NL46 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A6NL46 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms