Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms