Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms