Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPDC1A2A3K4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms